何だか海外から検索してやってきてらっしゃる方もいるようなので、英語でも書いておこう。 java -jar GenomeAnalysisTK.jar -T DepthOfCoverage -R foo.fa -I bar.bam -L bar.bed -omitBaseOutput -ct 10 -ct 20 & ##### ERROR ----------------------------…

いろいろ不審な点がある。 raw after MarkDuplicates After samtools -F 12 total 199260064 + 0 199260064 + 0 168640351 + 0 duplicates 0 + 0 8801525 + 0 4705460 + 0 mapped 177408978 + 0 (89.03%:-nan%) 177408978 + 0 (89.03%:-nan%) 168640351 + 0 …