heard'emsay

反省してます

東大医科研のスパコンはデフォルトのC コンパイラがICC

最適化の関係でしょうか?

GCCでないとコンパイルできないものもあるんですが、ICCだからダメだと言われるんじゃなくて「GCCのバージョンが古い」と怒られることが多く、gcc --version とやっても最新バージョンなのになー、と首を傾げることになります。例えばこんな感じ

$ ./configure 
:
:
configure: error: Your version of gcc does not support the 'std::tr1' standard. Recommended gcc version is 4.1.2 or later. Please use a newer gcc version, or try to download the pre-compiled binaries from the fastx-toolkit website.
$ gcc --version
gcc (GCC) 4.3.2
Copyright (C) 2008 Free Software Foundation, Inc.
This is free software; see the source for copying conditions.  There is NO
warranty; not even for MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.

環境変数CC を書き換えて使いましょう。