CASAVAで用いるSampleSheetには空白を入れてはいけない
題の通り。このことはよく知られていると思うんだけど、どのエラーが出た時にサンプルシートの空白を疑ったらいいのかなかなかわからない。僕の環境では以下のエラーが出たから、もし検索でここが引っかかった人はサンプルシートを確認するといいと思う。
CASAVA 1.8.2 configureBclToFastqにて
*** [Temp/L003_R2_demux_summary.xml] エラー 1 make: *** [Temp/L007_R1_demux_summary.xml] エラー 1 make: *** [Temp/L007_R2_demux_summary.xml] エラー 1 make: *** [Temp/L002_R1_demux_summary.xml] エラー 1 make: *** [Temp/L002_R2_demux_summary.xml] エラー 1 make: *** [Temp/L005_R1_demux_summary.xml] エラー 1 make: *** [Temp/L005_R2_demux_summary.xml] エラー 1 make: *** [Temp/L004_R1_demux_summary.xml] エラー 1 make: *** [Temp/L004_R2_demux_summary.xml] エラー 1 make: *** [Temp/L001_R1_demux_summary.xml] エラー 1 make: *** [Temp/L001_R2_demux_summary.xml] エラー 1 Command exited with non-zero status 2
しかし、空白が入っただけで動かなくなるなんて、大昔のロケットの制御プログラムみたいだね。