この辺にざっと目を通してる。「non-uniqueな配列が20%を超えたら警告出しますよ」とか言ってるんだけど、どれくらいのDepthを想定してるかとかにも依るやんか。Per base GC content もbase ごとのバラツキが5%を超えたら即警告と言ってるけど、平均が50%か…